La Oficina de Epidemiología es una unidad orgánica que brinda información estratégica y conduce la Vigilancia Epidemiológica, Análisis  de Situación de Salud e Investigación Epidemiológica aplicada como parte de la prevención y control de riesgos en enfermedades mentales y problemas psicosociales; es responsable de coordinar la organización en el Instituto de los aspectos relacionados con la salud mental en caso de emergencias y desastres.